Le Président de la CECAB est élu parmi les Evêques diocésains pour un mandat de trois ans renouvelable une fois, sauf en cas de force majeure. Il en est de même pour le Vice-Président.
Le Président et le Vice-Président constituent le Bureau de la Présidence. Ce Bureau peut être chargé de superviser certaines activités pastorales. Le Secrétaire de ce Bureau est le Secrétaire Général de la CECAB
S.E. Mgr Joachim NTAHONDEREYE
Evêque de Muyinga et Président de la CECAB
S.E.Mgr Bonaventure NAHIMANA
Archevêque de Gitega et Vice-Président de la CECAB